有着这样的误会，机械帝国很快就妥协，但认知文明要求摧毁五个元灵碎片，触动了机械族根本利益，原本的妥协变成了死命抵抗。
对机械文明来说，元灵碎片是文明的源泉力量，而认知文明不摧毁元灵碎片也无法完全掌控水星，双方没有任何和谈的条件。
认知文明1阶战士远不止3000名，随后又有两万多名1阶战士参战，控制了水星一片片天空区域。
面对认知文明的强势，五个机械帝国进行前所未有的联合，重新将五个元灵碎片集合到一起，拼接城一个完整的球体，散发出强烈的光芒，光芒中庞大的量子波动瞬间扫过整个水星，认知文明军队立刻受到了影响。
水星元灵即使很虚弱，但也是3阶，直接散发量子波动，对人类影响很大，人的灵魂核心毕竟也是量子能量系统。
人类通过量子讯息传送信号，控制无人机和纳米机器人，还有其他战争兵器，元灵的量子波动扫过整个星球，立刻就影响到了人类的控制系统，大量的无人机和战斗兵器失去控制，反攻人类。
甚至水星元灵对所有的人类进行催眠，散发一股股充满诱惑的量子波动。
3阶的力量只有3阶才能对抗，月球上的程进也释放出3阶的力量。
不过水星元灵还是给认知文明的军团带来了很大的损失，很多人类战士小队死在了元灵控制的战斗兵器手上。
这其中也有基石战士解锁基因，突破成为1阶的战士。
甚至还有1阶后期达到巅峰，或者突破成为2阶，到最后使得整个认知文明的2阶达到了10人，这其中自然也包括了林晨。
之后林晨加装了高等文明武装，重新加入了战争。
认知文明是越战越强，不断有基石战士突破成为1阶基因解锁者，也有1阶突破成为2阶，认知文明人口基数庞大无比，即使突破生死极限的人比例很小，最后突破的数量也很可观。
最后这场战争的关键变成3阶的战争，当程进的量子波动力量出现在水星上的时候，残破的水星元灵爆发出强烈的光芒，散发出股股不安的情绪。
同时，下一刻一股量子力量风暴爆发，庞大的能量以量子讯号的形式向四周围扩散，量子大潮迅速刮过整个星球，与程进控制的量子大脑进行量子信号波动上的较量。
水星元灵的量子波动也只能控制水星上的机械军团和认知文明的战斗兵器，这成了程进与它控制权上的战争。
水星元灵也属于一种高等思维体，但程进作为人类却拥有最终变量，还有打破思维结构的能力，拥有一种智慧，但是水星元灵只有成熟的思维结构，有无法打破某种思维的限制能力。
在散发出去的量子波动中只要有元灵无法打破的思维模式，水星元灵就奈何不了程进了，相反自己反而会被严重影响。
在思维智慧上，程进明显更胜一筹。
这次双方的较量，认知文明所有的1阶和2阶也都进行的旁观，程进将双方的较量都在认知空间中展示出来。
林晨也观看了整个过程，他能理解其中的凶险，那是心灵的较量，相当于是程进在渡心魔之劫，与心灵的邪魔展现自己的信念力量，渡不过就可能被对方破掉思维意识，思维混乱，人格泯灭，渡过了则会坚定自己的意志。
文明的战争，也有巨大的伤亡。
认知文明百万登陆军团，就足足损失了七十多万人。
战争结束，程进的量子波动横扫整个水星，发现在战场上出现了众多量子形态的能量波动，这些量子形态的能量波动不像固定的机械能量波动，会上下波动，有一个很大的变量。
这是程进第一次感应到这么多的量子波动。
虽然作为物质体的化学反应能量循环消失了，但更深一步的灵魂波动却没有消失，也就是量子能量波动，依旧存在于战场上。
如此大量的灵魂现象，林晨展开自己的灵魂感应也察觉到了这些力量。
程进的力量立刻连接这些环绕在战场上的量子能量波动，这些记录着大量信息的量子波动顺着讯号进入到地球的量子光脑中，连带着那些不确定变量也顺着量子波动记录的信号进入到里面。
大量的记忆信息在量子光脑中出现，然后生成一个个人体光影，还原成活着的时候的样子。
而且这些人体光影还有着记忆，许多人恍似刚刚清醒一般苏醒过来。
光影亮度不一，基石战士光亮最弱，1阶战士的光影亮如灯光，2阶战士的光影如一团或，而程进这个3阶亮度如太阳。
所有醒过来的意识体处在一片光芒的海洋中。
“应该先造一个虚拟世界。”程进强大的思维随后在量子光脑中构建了各种法则度与现实世界极度相似的世界。
这些量子光影随后在虚拟世界中生存，都保留着意识与记忆，很快记忆起了发生的一切，虽然觉得自己死去了非常遗憾，但是也觉得没办法。
“虽然你们死去了，但这却不表示就是终结，既然存在就说明有解决的办法，你们暂时在这里生存，文明解决了复生的问题会让你们复活的。”
交代完事情，程进的意识随后离开量子光脑的虚拟世界。
量子光脑是认知文明的最高科技结晶，如果量子光脑不被破坏，处在其中的量子能量波动就不会消亡，本身就是存在量子能量的环境，这些属于人类的量子波动生存在这里就如鱼生存在水中，不会消失，也不会消亡。
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